广海局岩心库
实验室共建单位广州海洋地质调查局样品库（岩心库）保存了大量的原始地质资料和实物样品资料。岩心库建筑面积约 1200 m2，由冷藏库、常温库和工作室组成，其中，冷藏库面积约 750 m2，控制温度 3 ～ 10℃，主要用于保存海洋沉积物样品；常温库面积约 200 m2，主要用于保存多金属结核、富钴结壳以及各类海底岩石样品。
海洋地质资料样品库冷藏库
样品库保存了上世纪 80 年代中期以来，我国南海、东海、太平洋、南极等海域超过2万个站位的海底沉积物、天然气水合物、多金属结核、富钴结壳、海底岩石等样品，沉积物岩芯长度超过2.5万米。是目前我国海洋地质领域保存样品最多的样品库。配备有岩心切割机、岩心扫描仪、天然气水合物保压储存设备等的国际先进的仪器设备。
广海局磁带库
广州海洋地质调查局磁带库位于南岗科研基地计算楼二楼，面积100平方米，配备无人值守恒温恒湿全天候精密空调、七氟丙烷气体自动消防系统及延时防爆照明系统等基础环境设备，符合磁记录产品存放要求。磁带库还配备了磁带管理系统、磁带转录系统及各类倒带机磁带机如3592、3590、3490/3480共15台，采用密集柜存储磁带，可存储8万盘磁带。
目前磁带库存放着1980年以来的野外调查原始数据和处理、研究后的最终成果数据磁带共2万多盘，备份磁带库（异地磁带备份库面积约50平方米）存放8000多盘备份磁带。
广州海洋地质调查局磁带库，2013年4月正式挂牌成为自然资源部（原国土资源部）海洋地质资料委托保管单位。
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