PI:钱培元教授简历
钱培元 教授
南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)副主任
南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)香港分部主任
香港科技大学 捷成David von Hansemann理学教授
香港科技大学 海洋科学系 讲座教授
香港科技大学 生命科学部 讲座教授
广州市南沙区南沙街资讯科技园海滨路1119号
电邮/邮箱: boqianpy@ust.hk
团队主页链接:https://qianlab.hkust.edu.hk/biography
个人简介:
钱培元,加拿大阿尔伯塔大学博士,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)副主任、香港分部主任,香港科技大学终身教授、荣誉冠名教授。1993年,加入港科大从事海洋幼虫生物学、生态学及天然产物化学研究;2018年,创建海洋科学系。历任港科大环境学科主任、海洋实验室创所主任、海洋科学系创系主任,校董、校监委,海洋分子生态学戈登会议创会主席,兼10余种国际海洋刊物编委。从事海洋科学研究30余年,首创我国融合生物海洋学、生态学、微生物学、天然产物化学等多学科为一体的海洋环境与生态研究平台。在Nature Review Microbiology、Nature Chemistry、Nature Chemical Biology、Nature Ecology & Evolution、Nature Communications、JACS、ISME J等国际期刊发表SCI论文500余篇,获中国发明专利13项、美国专利16项及欧洲专利1项,论文引用超31000次,H指数达88,入选全球顶尖2%科学家榜单。荣获国家自然科学奖二等奖(第一完成人)和国家海洋局科技进步奖一等奖(第二完成人)等,荣获中央政府颁发中华人民共和国成立70周年纪念奖章。
研究方向:
1.深海海洋无脊椎动物组学
2.海洋分子生态
3.海洋天然产物(基于基因组挖掘技术)
近年主要主持项目:
1.通过基因组挖掘和面向多样性合成获取新型抗生素。香港大学教育资助委员会合作研究基金。
2.冷泉生态基因组学,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)。
3.南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)香港分部,(项目负责人、主任)。
4.抗肿瘤、抗感染等活性天然产物合成途径的分析及异源表达(科技部重点研发计划)。子任务:抗肿瘤、抗感染及其他活性天然产物的多方向发现与激活。
5.冷泉生态系统与资源,广东省重大基础与应用基础研究项目。
6.一个用于研究环境胁迫因素对海洋生物影响的小型室内中宇宙实验设施(香港大学教育资助委员会,项目负责人)。
7. “U”形洋中脊热液喷口生态系统监测与保护。中国大洋矿产资源研究开发协会。(首席科学家)
8. 源自海洋微生物的抗生物被膜化合物,中国大洋矿产资源研究开发协会。
科研成果:
(1)代表性论文
1. Wang H, Xiao H, Feng B, Lan Y, Fung CW, Zhang H, Gan G, Lian C, Zhong ZS, Li J, Wang MX, Wu ARH*, Li CL*, Qian PY*. 2024. Single-cell RNA-seq reveals distinct metabolic “microniches” and close host-symbiont interaction in deep-sea chemosynthetic tubeworm. Sci Adv 10 (30), eadn3053. doi.org/10.1126/sciadv.adn3053.
2.Lan Y, Sun J, Chen C, Wang H, Xiao Y, Perez M, Yang Y, Kwan YH, Sun YN, Zhou YD, Han XQ, Miyazaki J, Watsuji T, Bissessur D, Qian JW, Takai, Qian PY*. 2022. Endosymbiont population genomics sheds light on transmission mode, partner specificity, and stability of the scaly-foot snail holobiont. ISME J 16, 2132-2143. Doi.org/10.1038/s41396-022-01261-4.
3.Xu T, Wang Y, Sun J, Chen C, Watanabe HK, Chen J, Qian PY*, Qiu JW*. 2021. Hidden historical habitat-linked population divergence and contemporary gene flow of a deep-sea patellogastropod limpet. Mol Biol Evol 38 (12), 5640-5654. https://doi.org/10.1093/molbev/msab278
4.Qian PY*, Cheng AF, Wang RJ, Zhang R. 2022. Marine biofilms:diversity, interactions and biofouling. Nat Rev Microbiol. https://doi.org/10.1038/s41579-022-00744-7.
5.Tang JW, Liu X, Ye W, Li ZR, Qian PY*, 2022. Biosynthesis and bioactivities of microbial genotoxin colibactins. Nat Prod Rept 39: 991-1014. DOI: 10.1039/d1np00050k rsc.li/npr
6.Xu T, Wang Y, Sun J, Chen C, Watanabe HK, Chen J, Qian PY*, Qiu JW*. 2021. Hidden historical habitat-linked population divergence and contemporary gene flow of a deep-sea patellogastropod limpet. Mol Biol Evol 38 (12): 5640-5654.
7.Zhou K, Xu Y, Zhang R, Qian PY*. 2021. Arm race in a cell: genomic, transcriptomic, and proteomic insights into intracellular phage-bacteria interplay in deep-sea snail holobionts. Microbiome 9(1): 1-13.
8.Sun YN, Sun J, Yang Y, Lan Y, Ip JCH, WC Wong, Kwan YK, YJ Zhang, Han Z, Qiu JW*, Qian PY*. 2021. Genomic signatures supporting the symbiosis and formation of chitinous tube in the deep-sea tubeworm Paraescarpia echinospica. Mol Biol Evol 38 (10): 4116-4134.
9.Geng Y, Liu C, Cai Q, Luo Z, Miao H, Shi X, Xu N, Fung CP, Choy TT,Yan B, Li N, Qian PY*, Zhou B*, Zhu G.* Crystal structure of parallel G-quadruplex formed by the two-repeat ALS- and FTD-related GGGGCC sequence, Nuc Aci Res 49 (10): 5881-5890. https://doi.org/10.1093/nar/gkab302.
10.Li, ZR, Sun J, Du YL, Pan AF, Zeng L, Maboundian R, Burne RA, Qian PY*, Zhang WJ*. Mutanofactin promotes bacterial adhesion and biofilm formation of cariogenic Streptococcus mutans. Nature Chemical Biology https://doi.org/10.1038/s41589-021-00745-2
11.Lan Y, Sun J, Chen C, Sun YN, Zhou YD, Yang Y, Zhang WP, Li RS, Zhou K, Wong WC, Kwan YH, Cheng AF, Bougouffa S, van Dover CL, Qiu JW, Qian PY*. 2021. Dual symbiosis in the deep-sea hydrothermal vent snail Gigantopelta aegis revealed by its hologenome. Nature Communication 12: 1165. https://doi.org/10.1038/s41467-021-21450-7
12.Malit JJL, Liu WC, Cheng AF, Saha S, Liu LL, Qian PY*. Global genome minining reveals a cytochrome P450-catalyzed cyclization of crownlike cyclodipeptides with neuroprotective activity. Organic Letter 23: 6601-6605. https://doi.org/10.1021/acs.orglett.1c01022
13.Yang Y, Sun J, Sun YN, Kwan YH, Wong WC, Zhang YJ, Xu T, Feng D, Zhang Y, Qiu JW, Qian PY*. 2020. Genomic, transcriptomic and proteomic insights into the symbiosis of deep-sea tubeworm holobionts. ISME J 14: 135-150. org/10.1038/s41396-019-0520-y
14.Nong WY, Cao JQ, Li YQ, Qu Z, Sun J, Swale T, Yip HY, Qian PY, Qiu JW, Kwan HS, Bendena W, Tobe S, Chan TF, Yip KYL, Chu KH, Ngai SM, Tsim KYK, Holland PWH, Hui JHL. Jellyfish genomes reveal distinct homeobox gene clusters and conservation of small RNA processing. Nature Communication 11: 3051 doi.org/10.1038/s41467-020-16801-9
15.Zhang WJ*, Qian PY*. Reply to: Macrocyclic colibactins. Nature Chemistry. 12(11): 1007-1007. doi.org/10.1038/x41557-020-00552-7.
16.Sun J, Chen C, Miyamoto N, Li RS, Sigwart JD, Xu T, Sun YN, Wong WC, Ip JCH, Zhang WP, Lan Y, Bissessur D, Watsuji T, Watanabe HK, Takaki Y, Qiu JW, Takai K*, Qian PY*. The Scaly-foot Snail genome and the ancient origins of biomineralised armour. Nature Communication 11: 1657. doi.org/10.1038/s41467-020-15522-3.
17.Li ZR, Li J, Cai WL, Lai JYH, Zhang WP, McKinnie SMK, Moore BS, Zhang WJ*, Qian PY*. Colibactin induces DNA double-strand breaks through copper-dependent oxidative cleavage. Nature Chemistry 11(10): 880-889.
18.Zhang WP, Ding W, Li YX, Tam CK, Bougouffa S, Wang RJ, Pei B, Chiang HY, Leung PM , Lu YH, Sun J, Fu H, Bajic VB, Liu HB, Webster NS, Qian PY*. 2019. Biofilms constitute a bank of hidden microbial diversity and functional potential in the oceans, Nature Communication 10: 517 https://doi.org/10.1038/s41467-019-08463
19.Sun J, Mu HW, Ip JCH, Li RS, Zhang YJ, Xu T, Kumagai N, Yusa Y, Accorsi A, Castro-Vasquez A, Vega IA, Heras H, Ituarte S, Bocxlaer BV, Hayes K, Cowie R, Zhao ZY, Zhang Y*, Qian PY*, Qiu JW*. Signatures of divergence, invasiveness, and terrestrialization revealed by four apple snail genomes. Mol Biol Evol 36: 1507-1520. Doi:10.1093/molbev/msz084.
20.Li YX, Zhong Z, Zhang WP, Qian PY*. 2018. Discovery of cationic nonribosomal peptides as gram-negative antibiotics through global genome mining. Nat Communi 9: 3273, 1038/s41467-018-05781-6.
21.Li YX, Zhong Z, Hou P, Zhang WP, Qian PY*. A widespread D-stereospecific resistance of nonribosomal peptide antibiotics. Nat Chem Biol 14: 381-388, doi.org/10.1038/s41589-018-0009-4
22.Sun J, Zhang Y, Xu T, Zhang Y, Mu HW, Zhang YJ, Lan Y, Fields CJ, Hui JHL, Zhang WP, Li RS, Nong WY, Cheung FKM, Qiu JW*, Qian P-Y*. 2017. Adaptation to deep-sea chemosynthetic environments as revealed by mussel genomes. Nat Ecol Evol 1: 0121 .
(2)主要专利
1.Discovery of cationic nonribosomal peptides as gram-negative antibiotics through global genome mining 美国专利 US 10,738,093 B2 1/4
2.Didemnin biosynthetic gene cluster in Tistrella mobilis 美国专利 US 9,644,005 B2 1/3
3.Diindol-3-ylmethanes as potent non-toxic antifouling compounds 美国专利 US 9,591,855 B2 1/4
4.Use of amide compounds for preventing marine biofouling 美国专利 US 9,131,691 B2 1/5
5.Antifouling method and composition using Chromen-4-one derivative 美国专利 US 8,557,331 B2 1/4
6.Use of marine fungus originated compounds as antifouling agents 美国专利 US 8,257,478 B2 1/5
7.Antifouling Furan-2-One Derivatives 美国专利 US 8,177,896 B2 1/6
8.Anti-fouling exopolysaccharides isolated from cultures of Vibrio alginolyticus and Vibrio proteolyticus 美国专利 US 7,090,856 B2 1/4
10.海洋微生物发酵产生的化合物在抗生物污损中的应用 中国专利 ZL 2005 1 0137017.2 1/5
主要获奖情况:
1.南海区域海洋生物种群多样性与生产机制,2009年,广东省人民政府,广东省科学技术奖,一等奖,第二完成人
2.海洋污染指示种多毛类小头虫的系统研究,1991年,国家海洋局,国家海洋局科学技术奖,一等奖,第二完成人
3.变化环境下生物膜对海洋底栖生态系统的影响,2016年,国务院,国家自然科学奖,二等奖,第一完成人
4.深海遗传资源调查与应用潜力评价,2020年,中国海洋工程咨询协会,海洋工程科学技术奖,一等奖,第二完成人